В рамках процедуры выборов ректора в университета проходят Советы факультетов, филиалов и структурных подразделений.
28 февраля 2011 года состоялся Совет Автодорожного факультета, по итогам которого на должность ректора университета была выдвинута кандидатура В.Н. Коротаева, проректора по науке и инновациям ПГТУ.